MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus LGA251 plasmid pLGA251

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017348	AATG	2	8	88	95	50 %	25 %	25 %	0 %	387781659
2	NC_017348	AT	3	6	108	113	50 %	50 %	0 %	0 %	387781659
3	NC_017348	A	6	6	118	123	100 %	0 %	0 %	0 %	387781659
4	NC_017348	TAG	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387781659
5	NC_017348	AAG	2	6	186	191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387781659
6	NC_017348	CAAAA	2	10	200	209	80 %	0 %	0 %	20 %	387781659
7	NC_017348	AACTA	2	10	264	273	60 %	20 %	0 %	20 %	387781659
8	NC_017348	AT	3	6	275	280	50 %	50 %	0 %	0 %	387781659
9	NC_017348	ATT	3	9	287	295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387781659
10	NC_017348	GATATG	2	12	348	359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387781659
11	NC_017348	A	6	6	382	387	100 %	0 %	0 %	0 %	387781659
12	NC_017348	TGG	2	6	436	441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387781659
13	NC_017348	A	7	7	568	574	100 %	0 %	0 %	0 %	387781659
14	NC_017348	ATA	2	6	1645	1650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387781660
15	NC_017348	CTT	2	6	1698	1703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387781660
16	NC_017348	TGT	2	6	1708	1713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387781660
17	NC_017348	TCA	2	6	1721	1726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387781660
18	NC_017348	ATTA	2	8	1732	1739	50 %	50 %	0 %	0 %	387781660
19	NC_017348	CCA	2	6	1796	1801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387781660
20	NC_017348	T	7	7	1859	1865	0 %	100 %	0 %	0 %	387781660
21	NC_017348	A	6	6	1880	1885	100 %	0 %	0 %	0 %	387781660
22	NC_017348	TTC	2	6	2029	2034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387781660
23	NC_017348	TA	3	6	2041	2046	50 %	50 %	0 %	0 %	387781660
24	NC_017348	T	7	7	2053	2059	0 %	100 %	0 %	0 %	387781660
25	NC_017348	TTA	2	6	2123	2128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387781660
26	NC_017348	CAA	2	6	2157	2162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387781660
27	NC_017348	TTAG	2	8	2207	2214	25 %	50 %	25 %	0 %	387781660
28	NC_017348	T	6	6	2255	2260	0 %	100 %	0 %	0 %	387781660
29	NC_017348	CAAC	2	8	2278	2285	50 %	0 %	0 %	50 %	387781660
30	NC_017348	CTT	2	6	2310	2315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387781660
31	NC_017348	TCGG	2	8	2426	2433	0 %	25 %	50 %	25 %	387781660
32	NC_017348	T	6	6	2477	2482	0 %	100 %	0 %	0 %	387781660
33	NC_017348	TTTTC	2	10	2526	2535	0 %	80 %	0 %	20 %	387781660
34	NC_017348	TC	3	6	2534	2539	0 %	50 %	0 %	50 %	387781660
35	NC_017348	GTT	2	6	2547	2552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387781660

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.